Новая версия набора GenSeqTM DNA Library kit

Компания «АНПРО» рада представить  улучшенную версию набора GenSeqTM DNA Library kit v1.1

В состав набора входит дополнительный компонент – Реагент В.

Он позволяет снизить стоимость подготовки библиотек. За счет уменьшения расхода магнитных частиц  более чем в два раза.

 

Узнать больше

О компании

Российская компания АНПРО (ANPRO) занимается разработкой и производством новых решений для высокопроизводительного секвенирования. Отличительной особенностью компании является выпуск собственной уникальной продукции для высокопроизводительного секвенирования, не имеющей аналогов в России и за рубежом, что позволяет нам конкурировать с крупными мировыми лидерами индустрии.

Непрерывная работа наших специалистов и тесное взаимодействие с непосредственными пользователями продукции обеспечивают постоянное развитие компании, расширение её ассортимента и своевременную реакцию на запросы сообщества, работающего с NGS технологиями.

Все продукты производства АНПРО проходят многоступенчатую проверку, в результате чего, наши клиенты получают гарантированно качественный результат. В настоящее время среди наших пользователей крупнейшие отечественные центры, использующие высокопроизводительное секвенирование на самых популярных на текущий день платформах – Illumina и Ion Torrent. Наши специалисты и сотрудники наших официальных дистрибьюторов всегда готовы оказать техническую и методологическую поддержку клиентам, помочь с внедрением наших технологий в работу лаборатории.

Связаться с нами

Миссия компании

Мы делаем высокие технологии простыми и доступными – помогаем медицине, науке, криминалистике использовать  возможности высокопроизводительного секвенирования следующего поколения в ежедневной работе лаборатории. Мы верим, что скоро секвенирование второго поколения станет доступно всем специалистам, работающим в этих областях, и поможет решить множество прикладных и глобальных проблем.  А наши решения станут неотъемлемой частью этих свершений.

 

Наши дистрибьюторы

Дистрибьютором продукции АНПРО на территории Российской Федерации и стран СНГ является компания Химэксперт.
По вопросам приобретения продукции АНПРО связывайтесь со специалистами Химэксперт.

Обратиться в Химэксперт 

 

По вопросам дистрибьюции

По вопросам дистрибьюции пишите запросы на наш электронный адрес

Продукция

GenSeq™ DNA Library kit v1.1   

GenSeq™ DNA Library kit v1.1  представляет собой кроссплатформенный набор для создания библиотек ампликонов для последующего анализа методом высокопроизводительного секвенирования на основе панелей AmpliSeqTM.

 

Описание 

В основе принципа работы набора GenSeq™ DNA Library kit v1.1  лежит мультиплексная ПЦР, в результате которой происходит обогащение целевых участков ДНК. Набор позволяет проводить секвенирование полученной библиотеки на двух платформах: Illumina и Ion Torrent. 

Преимущества набора: 

  • Впервые панели AmpliSeqTM доступны для пользователей Illumina, что дает возможность проводить кроссплатформенную валидацию результатов секвенирования
  • Высокая специфичность – больше 80%  прочтений картируется на целевые участки ДНК 
  • Высокая однородность покрытия целевых участков ДНК – больше 85% пар оснований с покрытием больше 20% от среднего покрытия
  • Достаточно 1-10 нг геномной ДНК на 1 пул праймеров
  • Срок хранения - 12 месяцев с момента производства

Ознакомиться с технологией работы набора 

Спецификация

Основные характеристики набора GenSeq™ DNA Library kit v1.1: 

  • специфичность - >80%
  • однородность - >85%
  • входящее количество материала – 1-10 нг геномной ДНК
  • срок хранения – 12 месяцев
  • температура хранения – все компоненты набора хранятся при -20°С 

Информация для заказа

Название Кол-во реакций Кат.№
GenSeq™ DNA Library kit v1.1  24 reactions 24 GEN-24
GenSeq™ DNA Library kit v1.1  48 reactions 48 GEN-48
GenSeq™ DNA Library kit v1.1  96 reactions 96 GEN-96
GenSeq™ DNA Library kit v1.1 384 reactions 384 GEN-384

При работе на платформе Illumina необходимо дополнительно приобрести индексы для маркировки образцов. 

 

 

 

 

GenSeq™ Набор индексированных праймеров 

GenSeq™ Index Primer Set – это набор индексов для двойного индексирования, рассчитан на 96 комбинаций индексов. Используется при создании библиотек с помощью набора GenSeq™ DNA Library kit v1.1 и панелей праймеров Ion AmpliSeqTM для последующего секвенирования на приборах платформы  Illumina.

Информация для заказа

Название Кол-во реакций Кат.номер
GenSeq™ Набор индексированных праймеров 96 GEN- IN-96

 

 

FAQ

С геномами каких организмов можно работать на наборе GenSeqTM DNA Library kit?

На наборе GenSeqTM DNA Library kit можно работать с геномом человека, животных и растений

На каких приборах можно работать с библиотеками, приготовленными с помощью набора GenSeqTM DNA Library kit?

Библиотеки, приготовленные с помощью набора GenSeqTM DNA Library kit, можно секвенировать на приборах линейки Illumina (MiniSeq System, MiSeq Series, NextSeq Series, HiSeq Series, NovaSeq Series) и приборах платформы Ion Torrent (Ion PGM, Ion Proton, Ion S5 Series).

Какие дополнительные наборы нужны для работы с набором GenSeqTM DNA Library kit?

Для приготовления библиотек с помощью набора GenSeqTM DNA Library kit необходимо дополнительно приобрести панель праймеров AmpliSeqTM (Thermo Fisher Scientific) и баркоды/индексы. В случае работы с платформой Illumina – это индексы GenSeq™ Index Primers 96 rx, производства АНПРО. В случае работы с платформой Ion Torrent – это стандартные баркоды Thermo Fisher Scientific.

Помимо этого, для проведения непосредственно секвенирования вам понадобятся стандартные наборы для темплирования и секвенирования в зависимости от платформы и прибора, на которых вы планируете провести работу.

Сколько ДНК понадобится мне для работы с набором GenSeqTM DNA Library kit?

Для приготовления библиотеки из одного пула праймеров достаточно от 10 до 1 нг геномной ДНК.

Какое качество должно быть у геномной ДНК для приготовления ДНК-библиотек с набором GenSeqTM DNA Library kit?

Возможна работа со следующими типами геномной ДНК: деградированная, замороженная и свежевыделенная ДНК.

Какой максимальный размер ампликона для создания библиотеки с помощью GenSeqTM DNA Library kit?

Максимальный размер ампликона для создания библиотеки с помощью GenSeqTM DNA Library kit – 400 п.н.

Какие панели праймеров совместимы с набором GenSeqTM DNA Library kit?

С набором GenSeqTM DNA Library kit совместимы все панели Ion AmpliSeqTM – как панели пользовательского формата (custom), так и  готовые панели Ion AmpliSeqTM.

Технология

 

 

GenSeq™ DNA Library kit создан для таргетного секвенирования. Секвенируйте на платформах Illumina и Ion Torrent с простым протоколом подготовки библиотек. Универсальный подход позволяет выбирать платформу для секвенирования в процессе создания библиотек.

Отличительная характеристика набора GenSeq™ DNA Library kit заключается в том, что при создании библиотек для обеих платформ Ion Torrent и Illumina используются одни и те же реактивы и условия протекания реакций. Что позволяет проводить подготовку библиотек для обеих платформ одновременно, в одном термоциклере и идеально подходит для проведения кроссплатформенной валидации результатов секвенирования.

 

Результат секвенирования на платформе Ion Torrent (Ion PGM™) при работе с различными панелями праймеров Custom AmpliSeq™. 

Библиотеки GenSeq™ DNA Library kit. Панели A, B, C, D, E, F на различных образцах ДНК
 
Панель A (Project 1) 508 amplicons (1 pool)  Read Length: 175 bp     
Панель D (Project 4, 8) 127 amplicons (2 pool)  Read Length: 225 bp     
Панель B (Project 2, 9) 538 amplicons (1 pool) Read Length: 275 bp
Панель E (Project 6) 384 amplicons (2 pool) Read Length: 375 bp     
Панель С (Project 3, 5) 226 amplicons (2 pool)  Read Length: 375 bp
Панель F (Project 7) 1255 amplicons (2 pool) Read Length: 275 bp      

 

 

Результат секвенирования на платформе Ion Torrent (Ion PGM™). На выборке образцов ДНК различного качества. Панель С. 

Панель праймеров С. Образцы ДНК 1-23. Количество входящего материала: 1 нг геномной ДНК. Генотипирование прово- дилось по панели из 226 ампликонов (2 пула). Длина прочтения: 375 п.н.

 

 

Результаты секвенирования Панели B на платформах Ion Torrent (Ion PGM™) и Illumina (MiSeq™). GenSeq™ DNA Library kit. Количество ДНК 1 нг. 

Панель праймеров B. Результаты секвенирования на приборах Ion PGM™ и MiSeq™

 

 

С набором GenSeq™ DNA Library kit у вас не возникнет вопросов в воспроизводимости эксперимента

Высокая корреляция профилей покрытия образцов GenSeq™ DNA Library kit. На графике приведены нормированные в диапазоне [0,1] значения (за 1 принято максимальное покрытие ампликона для соответствующего образца, за 0 нулевое покрытие). Для оценки корреляции образцов используется тау Кендалла (ранговая корреляция). tau Kendall 0,83, p-value < 2.2e-16

 

 


GenSeqTM NGS  Beads   

 

GenSeqTM NGS  Beads                                                                           

Магнитные частицы GenSeqTM NGS Beads предназначены для очистки NGS библиотек, а ткаже селекции библиотек по размерам. 

 

 

 

Совместимость                                  

GenSeqTM NGS Beads совместимы с наборами для подготовки библиотек производства компании ANPRO Ltd, а также других производителей.

 

Информация для заказа

 GenSeqTM NGS Beads будут доступны для заказа в начале четвертого квартала 2018 года.

 


 

GenSeqTM qPCR Library Quantification kit      

 

 

GenSeqTM qPCR Library Quantification kit                                                                          

Набор для измерения концентрации ДНК-библиотек без стадии преамплификации.

 

 

 

Совместимость

С платформой Ion Torrent

 

Преимущества

  • Укорачивается протокол подготовки библиотек
  • Исключаются 5 дополнительных циклов преамплификации
  • Исключение стадии преамплификации оптимально для сложных последовательностей (микросаттелиты, гомополимеры и т.д.)
  • Реализует конкурентное преимущество платформ Ion Torrent (возможность работы с минимальным количеством библиотек - концентрация - 100 пикомоль, в отличие от 4000 пикомоль для Illumina)

 

 

Информация для заказа

GenSeqTM qPCR Library Quantification kit будет доступен для заказа в начале четвертого квартала 2018 года.

 

 


GenSeqTM Fragment Library kit v1.0

Набор реагентов для приготовления библиотек фрагментов ДНК с целью последующего анализа методом высокопроизводительного секвенирования. Позволяет проводить секвенирование полученной библиотеки как на платформе Illumina, так и на платформе Ion Torrent.

 

Преимущества набора

  • Возможность кроссплатформенной валидации результата
  • Возможность проверки качества библиотек на менее производительной платформе (Ion Torrent) с последующей постановкой секвенирования на платформе Illumina
  • Простой и быстрый рабочий процесс
  • Оптимизированный протокол селекции по размерам на основе магнитных частиц
  • Широкий динамический диапазон:

Минимальное количество ДНК - 50 нг

Максимальное количество ДНК - 1000 нг

 

Приложения

  • Секвенирование геномов
  • Секвенирование экзомов
  • Метагеномика
  • Секвенирование ампликонов

 

 

Информация для заказа

GenSeqTM Fragment Library kit v1.0 будет доступен для заказа в начале четвертого квартала 2018 года.

 


 

Новости Все новости
АНПРО  на NGS конференции в Суздале
25-27 апреля 2018 года в Суздале пройдет  NGS конференция    
Читать далее
Технология мультиплексной ПЦР признана лучшим подходом для таргетного секвенирования
Метод мультиплексной ПЦР негласно признан самой лучшей технологией для таргетного секвенир...
Читать далее
Конференции «Генетика человека и патология», Томск
Приглашаем вас принять участие в Юбилейной XI научной конференции «Генетика человека и пат...
Читать далее