Новая версия набора GenSeqTM DNA Library kit

Компания «АНПРО» рада представить  улучшенную версию набора GenSeqTM DNA Library kit v1.1

В состав набора входит дополнительный компонент – Реагент В.

Он позволяет снизить стоимость подготовки библиотек. За счет уменьшения расхода магнитных частиц  более чем в два раза.

 

Узнать больше

О компании

Российская компания АНПРО (ANPRO) занимается разработкой и производством новых решений для высокопроизводительного секвенирования. Отличительной особенностью компании является выпуск собственной уникальной продукции для высокопроизводительного секвенирования, не имеющей аналогов в России и за рубежом, что позволяет нам конкурировать с крупными мировыми лидерами индустрии.

Непрерывная работа наших специалистов и тесное взаимодействие с непосредственными пользователями продукции обеспечивают постоянное развитие компании, расширение её ассортимента и своевременную реакцию на запросы сообщества, работающего с NGS технологиями.

Все продукты производства АНПРО проходят многоступенчатую проверку, в результате чего, наши клиенты получают гарантированно качественный результат. В настоящее время среди наших пользователей крупнейшие отечественные центры, использующие высокопроизводительное секвенирование на самых популярных на текущий день платформах – Illumina и Ion Torrent. Наши специалисты и сотрудники наших официальных дистрибьюторов всегда готовы оказать техническую и методологическую поддержку клиентам, помочь с внедрением наших технологий в работу лаборатории.

Связаться с нами

Миссия компании

Мы делаем высокие технологии простыми и доступными – помогаем медицине, науке, криминалистике использовать  возможности высокопроизводительного секвенирования следующего поколения в ежедневной работе лаборатории. Мы верим, что скоро секвенирование второго поколения станет доступно всем специалистам, работающим в этих областях, и поможет решить множество прикладных и глобальных проблем.  А наши решения станут неотъемлемой частью этих свершений.

 

Наши дистрибьюторы

Дистрибьютором продукции АНПРО на территории Российской Федерации и стран СНГ является компания Химэксперт.
По вопросам приобретения продукции АНПРО связывайтесь со специалистами Химэксперт.

Обратиться в Химэксперт 

 

По вопросам дистрибьюции

По вопросам дистрибьюции пишите запросы на наш электронный адрес

Продукция

GenSeq™ DNA Library kit v1.1   

GenSeq™ DNA Library kit v1.1  представляет собой кроссплатформенный набор для создания библиотек ампликонов для последующего анализа методом высокопроизводительного секвенирования на основе панелей AmpliSeqTM.

 

Описание 

В основе принципа работы набора GenSeq™ DNA Library kit v1.1  лежит мультиплексная ПЦР, в результате которой происходит обогащение целевых участков ДНК. Набор позволяет проводить секвенирование полученной библиотеки на двух платформах: Illumina и Ion Torrent. 

Преимущества набора: 

  • Впервые панели AmpliSeqTM доступны для пользователей Illumina, что дает возможность проводить кроссплатформенную валидацию результатов секвенирования
  • Высокая специфичность – больше 80%  прочтений картируется на целевые участки ДНК 
  • Высокая однородность покрытия целевых участков ДНК – больше 85% пар оснований с покрытием больше 20% от среднего покрытия
  • Достаточно 1-10 нг геномной ДНК на 1 пул праймеров
  • Срок хранения - 12 месяцев с момента производства

Ознакомиться с технологией работы набора 

Спецификация

Основные характеристики набора GenSeq™ DNA Library kit v1.1: 

  • специфичность - >80%
  • однородность - >85%
  • входящее количество материала – 1-10 нг геномной ДНК
  • срок хранения – 12 месяцев
  • температура хранения – все компоненты набора хранятся при -20°С 

Информация для заказа

Название Кол-во реакций Кат.№
GenSeq™ DNA Library kit v1.1  24 reactions 24 GEN-24
GenSeq™ DNA Library kit v1.1  48 reactions 48 GEN-48
GenSeq™ DNA Library kit v1.1  96 reactions 96 GEN-96
GenSeq™ DNA Library kit  384 reactions 384 GEN-384

При работе на платформе Illumina необходимо дополнительно приобрести индексы для маркировки образцов. 

 

 

 

GenSeq™ Набор индексированных праймеров 

GenSeq™ Index Primer Set – это набор индексов для двойного индексирования, рассчитан на 96 комбинаций индексов. Используется при создании библиотек с помощью набора GenSeq™ DNA Library kit v1.1 и панелей праймеров Ion AmpliSeqTM для последующего секвенирования на приборах платформы  Illumina.

Информация для заказа

Название Кол-во реакций Кат.номер
GenSeq™ Набор индексированных праймеров 96 GEN- IN-96

 

 

FAQ

С геномами каких организмов можно работать на наборе GenSeqTM DNA Library kit?

На наборе GenSeqTM DNA Library kit можно работать с геномом человека, животных и растений

На каких приборах можно работать с библиотеками, приготовленными с помощью набора GenSeqTM DNA Library kit?

Библиотеки, приготовленные с помощью набора GenSeqTM DNA Library kit, можно секвенировать на приборах линейки Illumina (MiniSeq System, MiSeq Series, NextSeq Series, HiSeq Series, NovaSeq Series) и приборах платформы Ion Torrent (Ion PGM, Ion Proton, Ion S5 Series).

Какие дополнительные наборы нужны для работы с набором GenSeqTM DNA Library kit?

Для приготовления библиотек с помощью набора GenSeqTM DNA Library kit необходимо дополнительно приобрести панель праймеров AmpliSeqTM (Thermo Fisher Scientific) и баркоды/индексы. В случае работы с платформой Illumina – это индексы GenSeq™ Index Primers 96 rx, производства АНПРО. В случае работы с платформой Ion Torrent – это стандартные баркоды Thermo Fisher Scientific.

Помимо этого, для проведения непосредственно секвенирования вам понадобятся стандартные наборы для темплирования и секвенирования в зависимости от платформы и прибора, на которых вы планируете провести работу.

Сколько ДНК понадобится мне для работы с набором GenSeqTM DNA Library kit?

Для приготовления библиотеки из одного пула праймеров достаточно от 10 до 1 нг геномной ДНК.

Какое качество должно быть у геномной ДНК для приготовления ДНК-библиотек с набором GenSeqTM DNA Library kit?

Возможна работа со следующими типами геномной ДНК: деградированная, замороженная и свежевыделенная ДНК.

Какой максимальный размер ампликона для создания библиотеки с помощью GenSeqTM DNA Library kit?

Максимальный размер ампликона для создания библиотеки с помощью GenSeqTM DNA Library kit – 400 п.н.

Какие панели праймеров совместимы с набором GenSeqTM DNA Library kit?

С набором GenSeqTM DNA Library kit совместимы все панели Ion AmpliSeqTM – как панели пользовательского формата (custom), так и  готовые панели Ion AmpliSeqTM.

Технология

 

 

GenSeq™ DNA Library kit создан для таргетного секвенирования. Секвенируйте на платформах Illumina и Ion Torrent с простым протоколом подготовки библиотек. Универсальный подход позволяет выбирать платформу для секвенирования в процессе создания библиотек.

Отличительная характеристика набора GenSeq™ DNA Library kit заключается в том, что при создании библиотек для обеих платформ Ion Torrent и Illumina используются одни и те же реактивы и условия протекания реакций. Что позволяет проводить подготовку библиотек для обеих платформ одновременно, в одном термоциклере и идеально подходит для проведения кроссплатформенной валидации результатов секвенирования.

 

Результат секвенирования на платформе Ion Torrent (Ion PGM™) при работе с различными панелями праймеров Custom AmpliSeq™. 

Библиотеки GenSeq™ DNA Library kit. Панели A, B, C, D, E, F на различных образцах ДНК
 
Панель A (Project 1) 508 amplicons (1 pool)  Read Length: 175 bp     
Панель D (Project 4, 8) 127 amplicons (2 pool)  Read Length: 225 bp     
Панель B (Project 2, 9) 538 amplicons (1 pool) Read Length: 275 bp
Панель E (Project 6) 384 amplicons (2 pool) Read Length: 375 bp     
Панель С (Project 3, 5) 226 amplicons (2 pool)  Read Length: 375 bp
Панель F (Project 7) 1255 amplicons (2 pool) Read Length: 275 bp      

 

 

Результат секвенирования на платформе Ion Torrent (Ion PGM™). На выборке образцов ДНК различного качества. Панель С. 

Панель праймеров С. Образцы ДНК 1-23. Количество входящего материала: 1 нг геномной ДНК. Генотипирование прово- дилось по панели из 226 ампликонов (2 пула). Длина прочтения: 375 п.н.

 

 

Результаты секвенирования Панели B на платформах Ion Torrent (Ion PGM™) и Illumina (MiSeq™). GenSeq™ DNA Library kit. Количество ДНК 1 нг. 

Панель праймеров B. Результаты секвенирования на приборах Ion PGM™ и MiSeq™

 

 

С набором GenSeq™ DNA Library kit у вас не возникнет вопросов в воспроизводимости эксперимента

Высокая корреляция профилей покрытия образцов GenSeq™ DNA Library kit. На графике приведены нормированные в диапазоне [0,1] значения (за 1 принято максимальное покрытие ампликона для соответствующего образца, за 0 нулевое покрытие). Для оценки корреляции образцов используется тау Кендалла (ранговая корреляция). tau Kendall 0,83, p-value < 2.2e-16

 

Новости Все новости
Технология мультиплексной ПЦР признана лучшим подходом для таргетного секвенирования
Метод мультиплексной ПЦР негласно признан самой лучшей технологией для таргетного секвенир...
Читать далее
Конференции «Генетика человека и патология», Томск
Приглашаем вас принять участие в Юбилейной XI научной конференции «Генетика человека и пат...
Читать далее
Новая версия набора GenSeqTM DNA Library kit
Компания «АНПРО» рада представить новую версию набора GenSeqTM DNA Library kit. Версия Gen...
Читать далее